Namnożony EM-1 czyli EM-A nie można używać do ponownego namnażania . W związku z tym że mikroorganizmy zawarte w EM mają rożne cykle rozmnażania, to skład preparatu po kilku namnażania będzie się mocno różniło od oryginalnego . Poza tym przy każdym namnażaniu dodamy mikroorganizmy z otoczenia które na początku są w śladowej ilości a później mogą stać się na przykład dominującymi, tak że już nie można mieć pewności jak preparat będzie oddziaływał.
